Esta colección es la más reciente creada, y cuenta con más de 10.000 ejemplares en proceso de catalogación. Agrupa invertebrados no insectos, tales como poríferos, moluscos, crustáceos, arácnidos, miriápodos, entre otros. Actualmente se encuentran catalogados 755 ejemplares y lotes de ejemplares. La colección cuenta con 211 lotes (1.293 individuos) sistematizados.
Ejemplares de esta colección provienen de registros de Parques Nacionales Naturales, lo que la perfila con gran potencial para el estudio y conocimiento de estos grupos de organismos poco estudiados en Colombia.
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